永嘉縣碧蓮鎮中學創辦于1988年，初始，租用碧蓮下村祠堂，后又租用碧蓮農械廠廠房作為教學場所，班級兩個，學生80余名，歸碧蓮鎮政府管轄。1997年碧蓮中學完成初高中分離任務，我校碧蓮鎮中坐落在永嘉縣碧蓮鎮碧蓮下村，是一所農村初級中學。學校建于1988年，始建時規模小，僅6個班級，校舍條件差，校園用地面積不足10畝。后經努力，學校辦學規模逐步擴大。1999年校園用地擴征后，占地面積達27畝，校園用地第一次做了較全面的規劃。

2003年茗岙中學并入本校，學校擔負著兩個鄉鎮的初中義務教育任務，原有規模已不能滿足辦學需要，校園用地再次擴征23畝，學校占地面積達到50畝，辦學規模進一步擴大，校園布局也在原基礎上做了規劃調整。

目前，碧蓮鎮中學有教學班24個，學生1172人，教職員工75名，校園規劃占地面積33350平方米(50畝)，是一所小楠溪流域辦學規模最大的學校，也是一所越來越受到鎮政府、教育局和社會各界重視的學校。