北京師范大學南山附屬中學創辦于2000年9月，是北京師范大學和深圳市南山區人民政府按照“國有聯辦、委托管理、自主辦學”的嶄新體制合作興辦的一所現代化公立中學。北師大南山附中是北京師范大學南山附屬學校的重要組成部分，包括初中部和高中部。

誕生于2000年9月的北京師范大學南山附屬中學，是北京師范大學與深圳南山區政府合作興辦的一年現代化的公立實驗中學。 學校坐落在深圳市南山區美麗的蔚藍海岸社區內，占地46000平方米，建筑面積38000平方米。校園的整體建筑是編難艦船式，體現了 現代建筑設計通透、明朗、開放的風格，各類場館設施、功能廳室、教學設備堪稱全國一流，為孩子們營造了一個優美、舒適、健康的學習環境。

學校按照“國有聯辦，委托管理，自主辦學”的嶄新辦學環境，充分依托北師大雄厚的教育資源和先進的教育技術，在“實施個性化 素質教育”這一辦學理念指導下，對于當代我國基礎教育的改革與發展進行了全方位的、獨有的探求。

現任校長彭雪花女士有豐富的教育教學經驗和管理經驗，在北京師范大學哲學和社會學院，她曾連續擔任了13屆班主任，并歷任級主任和系副主任。由于身兼多職，彭雪花校長自深圳北京師范大學南山附屬學校籌建之初，就一直是籌劃者、組織參與者、建設和管理者，因此，這所學校從建校初期到今天，其成長和發展的各個環節他都十分了解。而對于這所學校的今天和未來的發展，彭雪花校長更是早已有了自己長遠的打算。學校已從全國22個省市招聘教師128人，其中，特級教師3人，國家級骨干教師6人，高級職稱教師30人，碩士13人，教師學歷達標率為100%。 盡管學校創辦還不到兩年，但已顯示出強勁的發展勢頭。在教育教學教研中，取得了可喜的成績。全校教師有80余人次在區以上各級 各類比賽中嶄露頭角。