涼州區金山鎮九年制學校的前身是建于1958年的金山公社紅星小學，1972年，學校隨金山公社革委會搬遷至炭山村二組，1983年更名為金山鄉中學，1986年小學部分離另成立金山鄉炭山小學，學校成為獨立初中。2006年，炭山小學并入，學校改名為金山鄉九年一貫制學校。2009年至2015年，轄區內其他5所小學先后并入，2018年隨著撤鄉改鎮，學校更名為涼州區金山鎮九年制學校。

2022年，根據涼州區生態避險搬遷政策和金山鎮集中收縮安置新民居示范點發展需求，在金山鎮金山社區建設金山鎮九年制學校新校址。新校址總用地面積14931平方米(約22.4畝)，校舍總建筑面積2454.93平方米。2023年8月，學校正式遷往新校址辦學。

涼州區金山鎮九年制學校現有教學班9個，在校學生202人，在職教師31人，是金山鎮唯一的義務教育階段學校。多年來，學校始終秉承陽光育人、和諧發展的辦學思路，嚴格貫徹落實黨的教育方針，堅持立德樹人根本任務，全校教職工安貧樂教、甘于奉獻，學生踏實學習、自信自強，近幾年教學質量始終位居全區農村學校前列。學校注重學生全面發展，葫蘆絲、少兒舞蹈、足球等社團活動初見成效，尤其是足球運動成為學校特色。學校連續多年被涼州區教育局評為先進集體。